ТОНКЕ КАРТУВАННЯ І ПІДТВЕРДЖЕННЯ ЛОКУСУ QTL, ВІДПОВІДАЛЬНОГО ЗА ОЗНАКИ ВМІСТУ ВОЛОКОН І КОЛЬОРУ ОБОЛОНКИ НАСІННЯ, І ІДЕНТИФІКАЦІЯ МАРКЕРІВ SNP ДЛЯ МАРКЕР-ОПОСЕРЕДКОВАНОГО ВІДБОРУ НА ЦІ ОЗНАКИ В ЛІНІЇ КАНОЛИ З ЖОВТОЮ ОБОЛОНКОЮ НАСІННЯ (YSC) YN01-429 І В ЇЇ ЛІНІЇ ДИФЕРЕНЦІЮВАННЯ

1. Застосування виділеної нуклеїнової кислоти, яка має послідовність, пов'язану з низьким вмістом волокон з кислотним детергентом (ADF) в Brassica napus, вибрану з групи, яка складається з SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:111, для відбору рослини або зародкової плазми Brassica napus, які включають низький вміст ADF, при цьому рослина Brassica napus має ознаку низького вмісту волокон з кислотним детергентом, отриману з лінії YN01-429. 2. Застосування за п. 1, де виділена нуклеїнова кислота вибрана з групи, яка складається з SEQ ID NO:15, SEQ ID NO:16, SEQ ID NO:18, SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:20, SEQ ID NO:22, SEQ ID NO:23, SEQ ID NO:25, SEQ ID NO:26, SEQ ID NO:35, SEQ ID NO:38, SEQ ID NO:41, SEQ ID NO:43, SEQ ID NO:44, SEQ ID NO:45, SEQ ID NO:46, SEQ ID NO:47, SEQ ID NO:48, SEQ ID NO:49, SEQ ID NO:63, SEQ ID NO:72, SEQ ID NO:73, SEQ ID NO:75, SEQ ID NO:76, SEQ ID NO:77, SEQ ID NO:78 і SEQ ID NO:79. 3. Спосіб відбору рослини або зародкової плазми Brassica napus, що включає локус кількісних ознак (QTL), пов'язаний з низьким вмістом волокон з кислотним детергентом (ADF), де спосіб включає: відбір рослини або зародкової плазми Brassica napus, виходячи з наявності в рослині або зародковій плазмі маркерного алеля, пов'язаного з низьким вмістом ADF в нуклеїновій кислоті, вибраній з групи, яка складається з SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:111, при цьому рослина або зародкова плазма Brassica napus мають ознаку низького вмісту ADF, отриману з лінії YN01-429. 4. Спосіб за п. 2, за яким нуклеїнова кислота вибрана з групи, яка складається з SEQ ID NO:15, SEQ ID NO:16, SEQ ID NO:18, SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:20, SEQ ID NO:22, SEQ ID NO:23, SEQ ID NO:25, SEQ ID NO:26, SEQ ID NO:35, SEQ ID NO:38, SEQ ID NO:41, SEQ ID NO:43, SEQ ID NO:44, SEQ ID NO:45, SEQ ID NO:46, SEQ ID NO:47, SEQ ID NO:48, SEQ ID NO:49, SEQ ID NO:63, SEQ ID NO:72, SEQ ID NO:73, SEQ ID NO:75, SEQ ID NO:76, SEQ ID NO:77, SEQ ID NO:78 і SEQ ID NO:79. 5. Спосіб за п. 3 або 4, за яким рослину або зародкову плазму Brassica napus відбирають на основі наявності або відсутності гаплотипу, що включає множину маркерних алелів.

У даній заявці заявляться пріоритет дати подання попередньої заявки на патент США з реєстраційним номером 62/093963, що була подана 18 грудня 2014 року, від заголовком "Тонке картування i підтвердження локусу QTL, відповідального за ознаки вмісту волокон i кольору оболонки насіння, i ідентифікації маркерів SNP для маркер-опосередкованого відбору на ці ознаки в лінії каноли з жовтою оболонкою насіння (YSC) yn0l-429 i в лінії ii диференціювання" ("Fine mapping and validation of QTL underlying fiber content and seed coat color traits and identification of SNP markers for marker assisted selection of these traits derived form yellow seed coat (YSC) canola line YN01-429 and its lineage"), де вказана заявка у всій своїй повноті вводиться у даний опис за допомогою посилання. Галузь, до якої належить винахід Даний винахід стосується тонкого картування локусів кількісних ознак (QTL), асоційованих з низьким вмістом волокон i з YSC, i ідентифікації маркерів SNP для маркер-опосередкованого відбору на ці ознаки в рослині Brassica napus. Попередній рівень техніки Канола (Brassica napus L., 2n=4Х=38, AACC), алотетраплоїдна форма, яка походить від диплоїдів В. rapa (2n=2x=20, АА) i B. oleracea (2n=2x=18, CC), являє собою одну з найбільш важливих овочевих олійних культур, поширених у всьому світі, а зокрема, в Китаї, в Канаді, в Євросоюзі i в Австралії. Борошно з каноли, тобто, фракція насіння, що залишилась після розмелювання i екстракції олії, становить приблизно 55 % від об'єму насіння каноли. Борошно з каноли складається з декількох компонентів, включаючи білок, волокно, залишкову олію, вуглеводи i фактори з низькою поживною цінністю. Борошно з каноли містить приблизно 75 % білка, на відміну від соєвого борошна, що містять 48 % білка, i має 80 %-ву енергетичну цінність i 300 % неочишчених волокон, а також підвищені рівні факторів з низькою поживою цінністю, таких як глюкозиноляти, таніни, фітинова кислота, синапін i ерукова кислота, i таке борошно є в продажу як корм для худоби по ціні, що становить 60 %-70 % від ціни соєвого борошна. Див., наприклад, Hickling (2007) Canola meal competitive situation and Canola Council of Canada goals, Canola Meal Research Meeting, Saskatoon, Canada; Newkirk (2009) Canola meal feed industry guide (4th Edition). Відносно високий вміст волокна в борошні з каноли с фактором, який значно обмежує застосування цього борошна з метою приготування корму для тварин з однокамерним шлунком (Hickling, 2007; Newkirk, 2009). Оскільки борошно містить половину об'єму насіння каноли, а для отримання біопалива за період від 2006 до 2015 року було потрібне збільшення продукування насіння ріпаку на 67 % (Hickling, 2007), то виникла необхідність в модифікації композиційних властивостей борошна з каноли i в підвищенні її поживної цінності в порівнянні з поживною цінністю соєвого борошна. Вчені Сільськогосподарського інституту i Інституту з розробки сільгосппродуктів Канади (AAFC) розробили лінії з жовтою оболонкою насіння (YSC) (YN86-37, YN90—1016, YN97-262 i YNOI-429), що мають низький вміст лушпиння i більш тонку оболонку насіння, низький вміст волокна i високий вміст олії в порівнянні з канолою, що має чорну оболонку насіння (BSC) (Rakow et al., 2011). Дослідження кормів, в яких порівнювали властивості борошна каноли з жовтим насінням лінії AAFC YN01-429 із властивостями В. juncea, В. rapa i В. napus з коричневим насінням, продемонстрували переваги YSC-лінії В. napus, такі як більш високий вміст білка, більш низький вміст волокна, підвищена гідролізованість амінокислот i енергетичний склад, який металізується, а також підвищений рівень утилізації поживних речовин i енергії, виходячи з відношення корму до приросту маси у бройлерний курей i у тварин з однокамерним шлунком (Hickling, 2009; Slominski et al., 2010). Схрещування рослин з низьким вмістом волокна в значній мірі ускладнюється через нестачу інформації про успадковування i стабільність ознак низького вмісту волокна, а також відсутність надійних високоефективних маркерів, тісно зчеплених з цією ознакою. Через алотетраплоїдність дуже складно зрозуміти дію множини генів, материнські функції i ефекти навколишнього середовища, а також успадковування ознаки низького вмісту волокна, а тому досить важко ідентифікувати маркери, тісно зчеплені з цією ознакою. У публікації Somers et al, (2001) повідомлялось про ідентифікацію восьми рандомізованих ампліфікованих маркерів поліморфної ДНК (RAPD) для основного гену pigmentl), асоційованого з ознакою жовтої оболонки насіння YSC-лінії YN90-1016, з джерелом низького вмісту волокна YN97-262 i YN01-429, що використовуються в програмі схрещування рослин з низьким вмістом волокна, яка представлена заявниками (Rakow et al., 2011). Основний ген відповідальний за 72,3 %-ву зміну забарвлення насіння, а два додаткові гени, які розглядаються як другорядні, відповідальні за 21,5 %-ву зміну забарвлення (Somers et al., 2001). Було висловлено припущення, що низький вміст волокна в лінії з AAFC YSC YN01-429 i в її лінії диференціювання може контролюватися трьома рецесивними генами (Kubik and Thompson, 2009). Сучасна селекція ліній каноли з низьким вмістом волокна основана, головним чином, на даних про склад волокна, отриманих коштовними i трудомісткими аналітичними методами, або даних про колір оболонки насіння, оскільки ці дані у високому ступені корелюють з даними про низький вміст волокна в лініях AAFC У8С YN97-262 i YN01-429. Опис Конкретний варіант здійснення винаходу включає спосіб ідентифікації локусу кількісних ознак, асоційованих з бажаними поживними ознаками каноли. Цей спосіб включає аналіз популяції рослин каноли або зародкової плазми каноли на бажанні поживні ознаки. Генотип рослини або зародкової плазми каноли визначають із використанням щонайменше одного маркера, вибраного із групи, яка складається з послідовностей SEQ ID NO;1-SEQ ID NO:111. Рослини або зародкову плазму каноли картують на присутність локусу кількісних ознак (QTL), асоційованого з маркерами. QTL асоціюється з бажаною поживною ознакою. Інший варіант здійснення винаходу стосується виділеної i/або рекомбінантної нуклеїнової кислоти, яка має послідовність, асоційовану з QTL. QTL асоціюється з бажаною поживною ознакою рослини або зародкової плазми каноли. QTL також асоціюється щонайменше з одним маркером, вибраним із групи, яка складається із послідовностей SEQ Ю NO:1-SEQ ID NO:111. Інший варіант здійснення винаходу стосується способу селекції рослини або зародкової плазми каноли, яка містить бажані ознаки. Цей спосіб включає детектування в рослині або в зародковій плазмі каноли щонайменше одного маркера, зчепленого з QTL і вибраного із групи, яка складається із послідовностей SEQ Ю NO:1-SEQ ID NO: 111, де QTL асоціюється з бажаною поживною ознакою в рослині або в зародковій плазмі каноли. Потім проводять селекцію рослини або зародкової плазми каноли, виходячи з присутності маркера. Вищезазначені та інші ознаки винаходу будуть більш зрозумілі із нижченаведеного детального опису декількох варіантів здійснення винаходу, представлених з посиланням накреслення, що додають. Короткий опис креслень На фіг. 1 показаний розподіл індексу білини (WI) і %ADF в лініях Nex828 х YNO1-429 (YSC) DH. На лівому кресленні представлений графік залежності індексу білини (WI) оболонки насіння від % ADF в насіння каноли. На правому кресленні представлений % розподілу ADF серед DH-ліній. Число в дужках означає % ADF в насінні каноли. На фіг. 2 показаний розподіл індексу білини (WI) і %ADF в DH-лініях DN051493 X YNO1-429 (YDN). На лівому кресленні представлений графік залежності індексу білини (WI) оболонки насіння від % ADF в насінні каноли. На правому кресленні представлений % розподілу ADF серед DH-ліній, Число в дужках означає % ADF в насінні каноли. На фіг. 3А показана локалізація (на осі X) і коефіцієнт значущості (оцінка LOD на осі Y) QTL, ідентифікованого на N09. На фіг. 3В показаний адитивний ефект QTL, ідентифікованого на N09. На фіг. 4А показана локалізація (на осі X) і коефіцієнт значущості (оцінка LOD на осі Y) QTL, ідентифікованого на N11. На фіг. 4В показаний адитивний ефект QTL, ідентифікованого на N11. На фіг. 5А показана локалізація (на осі X) і коефіцієнт значущості (оцінка LCD на осі Y) QTL, ідентифікованого на N09, На фіг. 5В показаний адитивний ефект QTL, ідентифікованого на N09. На фіг. 6А показана локалізація (на осі X) і коефіцієнт значущості (оцінка LOD на осі Y) QTL, ідентифікованого на N11. На фіг. 6В показаний адитивний ефект QTLj ідентифікованого на NIL На фіг. 7 представлена карта інтервалу основного QTL ADF на N09, побудована з використанням даних для DH-популяції YDN. Було ідентифіковано 111 маркерів SNP з відстанню між QTL, що становить 4,9 сМ, включаючи фланкуючі маркери DBSNP01120 і DBSNP02172. У цьому інтервалі були також картовані локуси ADF_9 і WI_9. На фіг. 8 представлена карта N09, побудована для DH-популяцій YDN, YSC і TN, де показано, що 18 маркерів SNP були ідентифіковані в межах 0,0-4,9 сМ до основного QTL, відповідального за вміст волокна (ADF_9) і колір оболонки насіння (WI_9) на N09, Опис У даній заявці описані високоефективні маркери поліморфізму по одному нуклеотиду (SNP) і представлені генетичні карти високої щільності для тонкого картування і підтвердження локусів кількісних ознак (QTL), відповідальних за вміст волокна і колір оболонки насіння. У деяких варіантах здійснення винаходу, маркери SNP, тісно зчеплені з ознаками вмісту волокна і кольору оболонки насіння, можуть бути використані для маркер-опосередкованого відбору (MAS) бажаних поживних ознак ліній каноли з жовтим насінням (YSC). У конкретних варіантах здійснення винаходу, YSC-лінією може бути YSC-лінія ААРС YN01-429 і її лінія диференціювання. Також описаний спосіб модифікації маркерів SNP і представлені генетичні карти високої щільності, побудовані на основі ознак вмісту волокна і кольору оболонки насіння лінії AAFC YSC YNOl-429 з використанням великого набору фенотипічних даних про дві DH-популяції. У конкретних варіантах здійснення винаходу, основний QTL, який відповідальний за 59,2-74,7 % ознак мінливості вмісту волокна і кольору оболонки насіння, описаний на N09 в двох DH- популяціях, і другорядний QTL, який відповідальний за 1,4-7,2 % ознак мінливості вмісту волокна і кольору оболонки насіння, описаний на N11 в двох DH- популяціях. У обох популяцій є висока ступінь кореляції (R2=0,67-0,85) між ознаками кольору оболонки насіння (WI і L) і вмістом ADF. У даній заявці також описані 18 маркерів SNP на відстані 0,0-4,9 сМ від основного QTL, вмісту волокон і кольору оболонки насіння на N09 (див. фігуру 8), і 40 маркерів SNP на відстані 0,0-4Д сМ від другорядного QTL вмісту волокон і кольору оболонки насіння на N11, які можуть бути використані у варіантах маркер-опосередкованого відбору комплексних ознак низького вмісту волокна і YSC-лінії YN01-429 і її лінії диференціювання, що, тим самим, дозволяє удосконалити спосіб схрещування ліній каноли з низьким вмістом ADF, якщо YN01-429 або її лінія диференціювання використовується як джерело низького вмісту волокна в програмах по схрещуванню. Був створений продукт з низьким вмістом волокна для підвищення поживної цінності комерційно доступного борошна із каноли до 85-90 % від поживної цінності соєвого борошна із 48 % вмістом білка шляхом збільшення вмісту білка (від 36 % до 44 %) і істинної енергії, яка метаболізується (ТМЕ) (збільшення на 16 %-20 %), і зниження вмісту волокна (з 15-19 % до менш ніж 10 %). Передбачається, що такі удосконалення дозволять підвищити поживну цінність борошна з каноли, яке застосовується, зокрема, для приготування корму для тварин з однокамерним шлунком, і збільшити відсоток її вмісту в харчовому продукті. Були також розроблені YSC-лінії (YN86-37, YN90-1016, YN97-262 І YNOl-429), які мають низький вміст лушпиння і більш тонку оболонку насіння, низький вміст волокна і високий вміст олії в порівнянні із канолою, яка має чорну оболонку насіння (BSC) (Rakow et al., 2011). Дослідження кормів, в яких порівнювали властивості борошна каноли з жовтим насінням лінії AAFC YN01-429 із властивостями B. juncea, В. rара і В. napus з коричневим насінням, продемонстрували переваги YSC-лінії B napus, такі як більш високий вміст білка, більш низький вміст волокна, підвищена гідролізованість амінокислот і енергетичний склад, який метаболізується, а також підвищений рівень утилізації поживних речовин і енергії виходячи з відношення корму до приросту маси у бройлерний курей і у тварин з однокамерним шлунком (Hickling, 2009; Slominski et aL, 2010). Було проведене дослідження комбінацій ознак жовтого насіння/низького вмісту волокна в YSC-лініях YN97-262 і YN01-419, що містять певний профіль жирної кислоти омега-9, а також інших потрібних агрономічних ознак і якісних ознак насіння. L Картування і підтвердження ознак низького вмісту волокна і YSC в YN01-429 У переважному варіанті здійснення винаходу розкривається спосіб ідентифікації і картування локусів кількісних ознак (QTL), асоційованих з ознаками низького вмісту волокна і жовтої оболонки насіння (YSC) у рослин Brassica napus з використанням маркерів поліморфізму по одному нуклеотиду (SNF), У цих варіантах здійснення винаходу, QTL визначають в YSC-лінії YNO1-429. У деяких варіантах здійснення винаходу, маркери можуть бути використані для маркер-опосередкованого відбору на ознаки низького вмісту волокна і YSC в YSC-лінії YN01-429 і її лінії диференціювання. Були також ідентифіковані маркери SNP і представлені генетичні карти високої щільності, і ознаки вмісту волокна і кольору оболонки насіння були піддані тонкому картуванню і підтверджені в YSC-лінії AAFC YNOl-429 з використанням великого набору фенотипічних даних про дві дигаплоїдні популяції (DH). Ці експерименти більш детально описані в прикладах 1-5. Дві DH-популяції, YSC і YDN, були створені шляхом схрещування ліній ярових культур каноли. 183 DH-ліній YSC-популяції були отримані внаслідок схрещування ліній AAFC з жовтим насінням/низькими вмістом волокна YN01-429 і сорту з чорним насінням DAS Nexera/високий вмістом волокна Nex828, і культивовані разом з двома батьками на ділянках з парними рядами на експериментальній фермі AAFC Saskatoon і на експериментальній фермі DAS Rosthem в Канаді, 2007, для фенотипування. Зразки насіння із двох ділянок аналізували на AAFC за допомогою спектроскопії в ближньому інфрачервоному діапазоні (NIR) для волокна ADF (позначеного ADF_А на фігурах 3 і 4) і оцінювали в лабораторії Hunter на індекс білини оболонки насіння (позначений WI_A на фігурах 3 і 4) в 2007, Ця популяція була також проаналізована Аналітичною групою фахівців міста Індіанаполіса на ADF (позначеного ADF_A на фігурах 3 і 4) із застосуванням стандартного методу АОАС (АОАС Official Method 973.18) і Групою фахівців DAS Bioprocess м. Індіанаполіса на індекс білини оболонки насіння (позначений WID на фігурах 3 і 4) і в лабораторії Hunter на індекс світлового випромінювання (позначений L на фігурах 3 і 4) в 2011, 400 DH-ліній YDN-популяції були отримані шляхом схрещування сорту YN0I-429 і сорту з чорним насінням DAS Nexera/з високим вмістом волокна DN051493. YDN-популяцію культивували разом з двома батьками в місті Пайк Лейк (США) і в місті Кадворт в Канаді в 2011 для фенотипування. Зразки насіння аналізували на ADF (позначеного ADF_M1 і ADF_M2 на фігурах 5 і 6), на індекс білини оболонок насіння (позначений WI на фігурах 5 і 6) і на індекс світлового випромінювання (позначений L на фігурах 5 і 6) в лабораторії Hmiter. Третю DH-популяцію із 181 DH-лінії (позначену TN-популяцією), виведену шляхом схрещування сорту Tapidor (сорт Європейський озимий) і Ningyou7 (сорт Китайський напівозимий) додавали для побудови консенсусної карти, крім YSC- і YDN-популяцій, для картування QTL, відповідальних за ознаки вмісту волокна і кольору оболонки насіння, де TN-популяція не сегрегується за ознаками вмісту волокна і кольору оболонки насіння. Три DH-популяції генотипували з використанням 12000 маркерів SNP і будували консенсусну карту разом з окремою картою для YSC-, YDN- і TN-популяцій. Картування з інтервалами між складовими популяціями (СІМ) застосовували для сканування QTL по всьому геному. Після картування QTL, маркери SNP в інтервалі 0,0-5,0 сМ QTL, відповідального за вміст волокна і кольору оболонки насіння, маркери перетворювали для проведення аналізів KASPar на MAS цих ознак, що походять від лінії YN01-429 і її лінії диференціювання. Висока кореляція також спостерігалася між ознаками кольору оболонки насіння WI і L (R2=0,81-0,99) і між ознаками кольору оболонки насіння і вмістом ADF (R2=0,66-0,85) в обох популяціях (фігури 1 і 2). Через великий вплив основного QTL (R2=59,2 %-74,7 %) на N09 і бімодальних розподілів ознак вмісту волокна і кольору оболонки насіння в DH-лініях (фігури 1 і 2), кількісні ознаки вмісту волокна і кольору оболонки насіння можуть розглядатися як якісні ознаки, Після перетворення кількісних ознак ADF і WI в якісні ознаки, ADF (ADF_09) і WI (WI_09) були картовані на тій самій геномній області, де основний QTL був локалізований на N09 в обох YSC- і YDN-популяціях. На фігурі 7 представлена карта локалізації основного ADF і WI QTL, ADF09 і WI_09 на консенсусній карті N09, побудованій з використанням YSC-, YDN- і TN-популяцій і 323 маркерів SNP. Somers et al. (2001) і Rakow et al. (2011) показали, що YSC-лінія від AAFC дає стабільно низький вміст волокна в багатьох умовах навколишнього середовища, а низький вміст лігніну завжди асоціюється з жовтим кольором насіння. Генетична карта YSC була побудована з використанням 174 DLC і 2982 поліморфних маркерів SNP, де загальна довжина становила 2515,8 сМ, а середня довжина становила 0,80 сМ/маркер. YDN-популяцію конструювали з використанням 397 DH-ліній і 2972 маркерів SNP, де загальна довжина становила 2189 сМ, а середня довжина становила 0,74 сМ/маркер. Генетична карта TN була побудована з використанням 181 DH-лінії і 2716 поліморфних маркерів SNP, де загальна довжина становила 1905,7 сМ, а середня довжина становила 0,70 сМ/маркер. У цих варіантах здійснення винаходу описана консенсусна карта для 5500 маркерів SNP зі середньою довжиною 0,47 сМ, побудована з використанням YDN-, YSC- і TN-популяцій (фігура 7). YSC- і YDN-популяції були сегреговані за ознаками вмісту волокна і кольору оболонки насіння і були використані для картування QTL, а потім було підтверджено, що ознаки кольору оболонки насіння і ознаки вмісту волокна мали високу ступінь кореляції (фігури 3-6), Картування QTL показало, що основний QTL був ідентифікований на групі зчеплення (LG) N09, а другорядний QTL був ідентифікований на LG N11 для всіх ознак кольору оболонки насіння (WI і L) і вмісту ADF в обох популяціях (фігури 4-6). У YSC-популяції, основний QTL, ідентифікований на N09, був відповідальний за 71,5 % мінливість ADF і співпадав із основним QTL, відповідальним за 59,2 % мінливість WI і за 60,8 % мінливість індексу світлового випромінювання (L) при величинах LOD від 40 до 47 (фігура 3), Другорядний QTL, ідентифікований на N11, був відповідальний за 2,4 % мінливість ADF, і співпадав із другорядним QTL, який відповідно відповідальний за 7,2 % мінливість WI і за 6,3 % мінливість індексу світлового випромінювання (L) при величинах LOD від 5 до 9 в Nex828 х YN01-429-пoпyляції (фігура 4).) Аналіз QTL в YDN-популяції додатково підтвердив результати, отримані для YSC-популяції. Основний QTL, ідентифікований на N09, був відповідальний за 73,4 % мінливість ADF, і співпадав із основним QTL, який відповідно відповідальний за 74,0 % мінливість WI і за 74,7 % мінливість індексу світлового випромінювання (L) при величині LOD від 143 (фігура 5). Другорядний QTL, ідентифікований на N11, був відповідальний за 1,4 % мінливість ADF, і співпадав із другорядним QTL, який відповідно відповідальний за 5,9 % мінливість WI і за 5,7 % мінливість індексу світлового випромінювання (L) при величинах LOD від 3 до 32 (фігура 6). Отримані результати відповідали результатам, отриманим Somers et al. (2001), що вказувало на те, що основний ген був відповідальний за 72,3 % мінливість кольору насіння, а два додаткових гени розглядалися як другорядні і були відповідальні за 21,5 % мінливість кольору. Оскільки QTL кольору оболонки насіння (WI і L) абсолютно співпадав із QTL вмісту волокна і був відповідальний майже за той самий відсоток фенотипїчної мінливості (R2=77,4 %) як і QTL вмісту ADF в обох DH-популяціях, що походять від YN01-429, то можна зазначити, що індекси кольору оболонки насіння (WI і L) є хорошим індикаторами вмісту волокна в насінні каноли, якщо YSC-лінія YN01-429 або її лінія диференціювання використовувались як джерело низького вмісту ADF в програмах по схрещуванню. II. Маркери SNP і QTL, відповідальні за ознаки низького вмісту волокна і YSC в YN01-429 У деяких варіантах здійснення винаходу описаний основний QTL, який відповідальний за 59,2-74,7 % фенотипічну мінливість ознак вмісту волокна і кольору оболонки насіння в двох дигаплоїдних (DH) популяціях рослин. У конкретних варіантах здійснення винаходу було виявлено, що другорядний QTL відповідальний за 1,4-7,2 % фенотипічну мінливість цих ознак в двох дигаплоїдних популяціях рослин. Був виявлений високий ступінь кореляції між ознаками кольору оболонки насіння (WI і L) і вмісту ADF в обох популяціях. У альтернативному варіанті здійснення винаходу, набір високоефективних маркерів тісно зчеплений з ознаками вмісту волокна і кольору оболонки насіння в YSC-лінії YNO1-419. У інших варіантах здійснення винаходу, послідовності нуклеїнової кислоти, зчеплені з QTL, асоційовані з потрібними поживними знаками. Ця послідовність може походити від лінії з жовтою оболонкою насіння (YSC) YN01-429 або її лінії диференціювання. Конкретні варіанти здійснення винаходу стосуються набору з 18 маркерів SNP, які знаходяться в межах 0,0-4,9 сМ від основного QTL ADF і кольору насіння (WI), ідентифікованого в DH-популяціях Nex828 X YNOl-429 (YSC) iDN051493 x YNOl-429 (YDN). У конкретному варіанті здійснення винаходу, маркерами SNP є маркери, ідентифіковані на фігурі 7 як DBSNP357222-DBSNP2222m, які фланковані DSNP01120 і DSNP02172. У іншому варіанті здійснення винаходу, маркерами SNP є DBSNP357223, DBSNP357224, DBSNP357226, DBSNP357227, PBSNP3.57228, DBSNP357230, DBSNP357231, DBSNP357233, DBSNP357234, DBSNP357244, DBSNP357247, DBSNP357250, DBSNP357252, DBSNP357253, DBSNP357254, DBSNP357255, DBSNP357256, DBSNP357257, DBSNP357258, DBSNP357273, DBSNP357287, DBSNP357288, DBSNP357290, DBSNP357291, DBSNP357292, DBSNP357293 і DBSNP357294, як показано на фігурі 7. Ш. Маркер-опосередкований відбір (MAS) ознак низького вмісту волокна і YSC в YN01-429 Деякі варіанти здійснення винаходу стосуються способу селекції рослин або зародкової плазми каноли з метою відбору на потрібну поживну ознаку, асоційовану з QTL, за допомогою маркер-оносередкованого відбору (MAS), Так, наприклад, може бути використана YSC-лінія YN01-429, Оцінка кольору насіння може бути проведена замість коштовного і тривалого мокрого хімічного аналізу на вміст волокна. Описані маркери SNP, розташовані в межах 4,9 сМ від основного QTL вмісту волокна і кольору оболонки насіння на N09 або другорядного QTL вмісту волокна і кольору оболонки насіння на N11, можуть бути використані для MAS, і значно полегшують відбір ліній каноли, які мають низький вміст волокна, тобто, одну з найбільш важливих ознак продукту з низьким вмістом волокна DAS. У конкретних варіантах здійснення винаходу описаний спосіб застосування ідентифікованого QTL в маркер-опосередкованому відборі (MAS) комплексних ознак вмісту волокна і кольору оболонки насіння в YSC-лінії YN01-429 для полегшення селекції рослин Brassica і більш ефективного відбору бажаних поживних ознак. Конкретні варіанти здійснення винаходу стосуються маркер- опосередкованого відбору сортів каноли з метою підвищення поживної цінності борошна з каноли, зокрема, з метою приготування кормів для тварин, включаючи тварин з однокамерним шлунком і жуйних тварин. Відповідно до деяких варіантів здійснення винаходу, вказаний спосіб може бути застосований для відбору насіння або зародкової плазми каноли, які містять в середньому щонайменше приблизно 44 % неочищеного білка і не більше ніж приблизно 14 % волокна з кислотним детергентом як було визначено за допомогою NIR на основі сухої маси. У альтернативних варіантах здійснення винаходу, насіння або зародкова плазма каноли можуть також містити в середньому щонайменше приблизно 49 % неочищеного білка. У інших варіантах здійснення винаходу- насіння або зародкова плазма каноли можуть містити в середньому не більше ніж приблизно 12 % волокна з кислотним детергентом. Крім того, насіння або зародкова плазма каноли, відібрані описаним способом, можуть також мати наступні ознаки: знижений вміст глюкозиноляту, низький вміст таніну і/або низький вміст стінок залишкових клітини. IV. Абревіатури ADF Волокно з кислотним детергентом АМЕ Позірна енергія, яка метаболізується DAS Dow AgroSciences DH Дигаплоїдний FAME Жирна кислота/метилової ефіри жирної кислоти NMR (ЯМР) Ядерний магнітний резонанс NIR Спектроскопія в ближньому інфрачервоному діапазоні QTL Локус кількісних ознак RAPD Рандомізована ампліфікована поліморфна ДНК SNP Поліморфізм по одному нуклеотиду RCW Стінки залишкових клітин V. Терміни Алотетраплоїд: Використовуваний тут термін ≪алотетраплоїд≫, в основному, стосується гібридного організму, у якого набір хромосом в чотири рази перевищує набір хромосом у гаплоїдному організмі. Олія каноли: Олія каноли являє собою олію, екстраговану з комерційно доступних сортів ріпаку. Для продукування олії каноли, насіння зазвичай сортують і змішують в зернових елеваторах із отриманням досить однорідного продукту. Потім змішане зерно розмелюють, і олію зазвичай екстрагують гексаном, після чого рафінують. Потім отримана олія може надходити в продаж. Вміст олії зазвичай визначають як відсоток цільного сухого насіння, а конкретний вміст олії є відмітною властивістю різних сортів каноли. Вміст олії може бути легко визначений рутинними способами із застосуванням різних аналітичних методів, таких як, наприклад, але не обмежуючись ними, ЯМР; NIR; і екстракція Сокслета. Відсотковий склад загальних жирних кислот зазвичай визначають шляхом екстракції зразка олії з насіння, продукування метилових складних ефірів жирних кислот, присутніх в зразку олії, і аналізі кількості жирних кислот в зразку за допомогою газової хроматографії. Склад жирних кислот може також служити відмітною ознакою конкретних сортів. Елітна лінія: Використовуваний тут термін ≪елітна лінія≫ означає будь-яку лінію, виведену шляхом схрещування і селекції на найкращі агрономічні властивості. Елітною рослиною є будь-яка росліша, що походить від елітної лінії. Борошно з каноли з поліпшеними властивостями: Використовуваний тут термін ≪борошно з каноли з поліпшеними властивостями≫ означає борошно з каноли, отримане з насіння каноли, яке має знижений вміст волокна і може мати підвищений вміст білка і підвищений рівень істинної енергії, яка метаболізується, а також знижений вміст факторів з низькими поживними властивостями, таких як глюкозиноляти, таніни, фітинова кислота, кислота і ерукова кислота. Борошно з деякими або всіма цими властивостями дозволяє підвищити рівень його вмісту в кормі для тварин, а зокрема, тварин з однокамерним шлунком. Лінія рослини: Використовуваний тут термін ≪лінія≫ означає групу рослин, які мають невелику генетичну мінливість (або, наприклад, що не мають генетичної мінливості) між окремими видами щонайменше за одною ознакою. Інбредні лінії можуть бути створені з декількох поколінь за допомогою самозапилення і відбору, або, альтернативно, за допомогою вегетативного розмноження з одного з батьків із застосуванням методів культивування тканин або клітин. Використовуваний тут термін ≪сорт≫, ≪різновид≫ і ≪тип≫ є синонімами і означають лінію, яка використовується для промислового виробництва. Рослинний матеріал: Використовуваний тут термін ≪рослинний матеріал≫ означає будь-який оброблений або необроблений матеріал, що походить із суцільної рослини або її частини. Так, наприклад, рослинним матеріалом може бути, але не обмежуються ними, частина рослини, насіння, плоди, листя, коріння, тканина рослини, культура тканини рослини, рослинний експлантат або клітина рослини. Кількісна ознака: Використовуваний тут термін ≪кількісна ознака≫ може означати ознаку або фенотип, який експресується в різному ступені, в основному, у безперервному градієнті, і часто зчеплений з одним або більше генами, і на який впливають фактори навколишнього середовища. Локус кількісних ознак: Використовуваний тут термін ≪локус кількісних ознак≫, означає сегмент або область ДНК, яга містять ген або зчеплені з геном або генами, відповідальними за кількісну ознаку. Колір насіння: У деяких своїх варіантах, даний винахід стосується сортів каноли (наприклад, інбредних ліній і гібридів каноли), що характеризується кольором насіння. Колірність насіння каноли або ≪колір насіння≫ переважно оцінюють за шкалою 1-5, виходячи з оцінки насіння, отриманої від здорових рослин зі зрілим насінням або з майже зрілим насінням. ≪1≫ означає яскраво-жовтий колір. ≪2≫ означає, головним чином, жовтий колір з невеликим коричневим відтінком. ≪З≫ означає суміш коричневого і жовтого кольорів. ≪4≫ і ≪5≫ означають коричневий і чорний колір, відповідно. Оцінки індексу білини (WI) можуть бути також використані для опису сортів каноли. Так, наприклад, лінії з жовтим насінням YN97-262 і 9592 мають оцінки індексу білини -34,6 і -33,2, відповідно, і оцінку кольору насіння≪1≫. Лінії з темним насінням, Nex 715 і Nex 705, мають оцінки індексу білини -0,2 і -4,4, відповідно, і оцінку кольору насіння≪4≫. Лінії з темним насінням 46А65 і Q2 мають оцінки індексу білини 0,3 і -3,9, відповідно, і оцінку кольору насіння≪5≫. Колір конкретного насіння може бути також виражений у відсотках або в інших співвідношеннях у порівнянні з бyдь-яким з цих ліній. Стабільність: Використовуваний тут термін ≪стабільність≫ або ≪стабільний≫ стосується даного компонента рослин, який підтримується, по суті, на одному і тому рівні в багатьох поколіннях. Так, наприклад, стабільній компонент може зберігатися щонайменше в трьох поколіннях, в основному, на одному і тому рівні. У цьому контексті, термін ≪в основному, на одному і тому рівні≫ може стосуватись, в деяких варіантах здійснення винаходу, компонента, який зберігається на рівні 25 %, на рівні 20 %; нарівні 15 %; нарівні 10 % нарівні 5 %; нарівні 3 %; нарівні 2 % і/або нарівні 1 % в двох різних поколіннях, а також компонента, який абсолютно повністю зберігається в двох різних поколіннях. У деяких варіантах здійснення винаходу, стабільним компонентом рослин може бути, наприклад, але не обмежується ними, компонент олія, компонент білок, компонент волокно, компонент пігмент, компонент глюкозинолят і компонент лігнін. На стабільність компонента можуть вплітати один або більше факторів навколишнього середовища. Так, наприклад, на стабільність компонента ≪олія≫ можуть виливати, наприклад, але не обмежуються ними, температура, локалізація, стрес і час посіву. Передбачається, що подальші покоління рослин, що мають стабільний компонент в польових умовах, будуть продукувати такий компонент за аналогічним механізмом, наприклад, як описано вище. Ознака або фенотип: використовуваний тут термін ≪ознака≫ і ≪фенотип≫ є синонімами. З метою розкриття даного винаходу, потрібно зазначити, що ознаками, які представляють особливий інтерес, є низький вміст волокна і колір оболонки насіння. Деякі сорти каноли мають жовту оболонку насіння, а деякі сорти каноли мають темну (наприклад, чорну, темну і плямисту) оболонку насіння. Термін ≪різновид≫ або ≪сорт≫ означає лінію рослини, яка використовується в промисловому рослинництві, і яка, при її розмноженні, зберігає особливі, стабільні і однорідні властивості. Якщо це не обговорене окремо, то артиклі ≪а≫ або ≪аn≫ означають ≪щонайменше один≫. Всі цитовані тут роботи, включаючи публікації, патенти і патентні заявки, у всій своїй повноті і у всіх цілях вводяться в даний опис за допомогою посилання так, якби як кожна окрема публікація, окремий патент або окрема патентна заявка були конкретно і окремо введені у всій своїй повноті і у всіх цілях в опис даного винаходу, у даній заявці обговорюються лише ті матеріали, із посиланнями, які були подані до дати подачі даної заявки. Цитування будь-якої публікації, наданої для її розкриття до дати подачі, не повинно бути витлумачене як визнання того, що автори винаходу не мають право датувати таку публікацію заднім числом на основі попереднього винаходу. Приклади Нижченаведені приклади наводяться для ілюстрації деяких конкретних ознак і/або аспектів. Ці приклади не повинні розглядатися як обмеження об'єму описаних тут конкретних ознак або аспектів. Приклад 1: Рослинний матеріал і екстракція ДНК Для тонкого картування і підтвердження ознак низького вмісту волокна і кольору оболонки насіння в лінії з жовтою оболонкою насіння (YSC) YNO1-429 були отримані дві дигаплоїдні (DH) популяції, YSC і YDN, за допомогою схрещування ярових ліній каноли в 2007 і 2010 роках, відповідно. 176 DH-ліній YSC-популяцій були виведені вченими Сільськогосподарського інституту і Інституту з розробки сільгосппродуктів Канади (AAFC) шляхом схрещування ліній з жовтим насінням, яке має низький вміст волокна YNO 1-429, і ліній з чорним насінням DAS Nexera, тобто, різновидів Nex828 з високим вмістом волокна. 399 DH-ліній YDN-популяції були виведені шляхом схрещування ліній YN01-429 і ліній DAS Nexera з чорним насінням, тобто, різновидів DN051493 з високим вмістом волокна. DH-популяція, TN, була виведена шляхом схрещування Європейського озимого сорту Tapidor і Китайського напівозимого сорту "Nringyou7. Ця популяція являє собою еталонну популяцію для картування, що широко застосовується з метою картування ознак і дослідження геноміки Міжнародним Співтовариством по дослідженню каноли (Shi et al 2009), і така популяція не сегрегується за ознакою вмісту волокна і кольору оболонки насіння. Ця популяція, поряд з YSC- і YDN-популяціями, була використана для побудови консенсусної карти з метою ідентифікації більшої кількості маркерів поліморфізму по одному нуклеотиду (SNP), тісно зчеплених з ознаками вмісту волокна і кольору оболонки насіння. Геномну ДНК популяцій екстрагували із 8 перфорованих листків на зразок із застосуванням методу екстракції DAS Віосеї (Bohl еі аІ. 2009). Зразки ДНК кількісно оцінювали за допомогою набору для кількісної оцінки ДНК Quant-iTТМ PicoGreenТМ (Invitrogen, Carlsbad, CA) відповідно до інструкцій виробників або на спектрофотометрі Nanodrop 8000 (Thermo Scientific, Waltham, MA) відповідно до інструкцій виробників. Приклад 2: Фенотипічні дані 176 DH-ліній YSC-популяції були культивовані разом з двома батьками на ділянках з парними рядами на експериментальній фермі AAFC Saskatoon і на експериментальній фермі DAS Rosthern в Канаді в 2007 р. для фенотипування. Зразки насіння з двох ділянок аналізували в AAFC за допомогою спектроскопії в ближньому інфрачервоному діапазоні (NIR) на волокно з кислотним детергентом (ADF) і на індекс білини оболонки насіння (WI). Ця популяція була також проаналізована на ADF із застосуванням стандартного методу АОАС (офіційно затвердженого методу АОАС 973.18) в 2007 р., а також на індекс білини оболонки насіння і на індекс світлового випромінювання в лабораторії Hunter (L) в 2011 p. YDN-популяцію культивували разом з двома батьками на ділянках з парними рядами в місті Пайк Лейк і в місті Кадворт в Канаді в 2011 році для фенотипування. Зразки насіння від 361 DH-лінії аналізували на ADF з використанням двох NIR-моделей, а також на індекс білини оболонок насіння і на індекс світлового випромінювання в лабораторії Hunter в 2011p. Між двома батьками, при картуванні на вміст волокна і кольору оболонки насіння в обох популяціях, спостерігалися значущі відмітності, як проілюстровано в таблиці 1. Було виявлено, що розподіл вмісту волокна в DH-лініях був бімодальним і мав тенденцію до збільшення вмісту волокна в обох популяціях (фігури 1 і 2), Високий ступінь кореляції спостерігався між ознаками кольору оболонки насіння WI і L (R2=0,81-0,99) і між ознаками кольору оболонки насіння і ознаками вмісту волокна (R2=0,66-0,85) в обох популяціях (фігури 1 і 2). Таблиця 1:Дані %ADF і кольору оболонки насіння, WI і L батьків і DH- ліній в YSC' і YDN-популяціяхОзнакаYDN-популяціяYDN-популяціяNex 828YN01-429DH-ліяіі з алелями Nex828DH-лінії з алелями YN01—429DN0514 93YN0 1-429DH-лікfі з алелями DN05I4 93DH-лінїі з алелями УN01-429% ADF15,6%9,1 %14,0 +1,6 %67,110,01,0 %100,419,0 %12,6%18,5 +1,4 %68,0 +12,8 к0,9 %123,5 тWI68,0145,64,273,1 *19,2109,9 +67,9159,35,074,119,6134,8 +L74,4157,75,020,874,4172,15,920,8 Приклад 3: Генотипні дані Три DH-популяції, YSC, YDN і TN, були генотиповані за 12000 маркерами SNP, які були отримані в DAS на двох чипах Illumina Infinium на установці BeadStation 500 G відповідно до протоколу виробників (Illumina, San Diego, СА). Генотипні дані аналізували з використанням модуля для аналізу генотипу GenomeStudio vl.8.4 (Illumina, San Diego, С A), який перетворює флуоресцентні сигнали для кожного SNP в сигнали А і В, величини яких вказують на відносну надмірність довільно привласнених алелів А і В. Сигнал перетворювали в полярні координати із використанням манхетенівської метричної відстані для іигенсивності R і з використанням Theta= [0,1] який представляє кут =[0,90] градусів. Кожний маркер кластеризували в декартових координатах, і генотипи {АА, АВ, ВВ} присвоювали зразкам, кластери яких найбільш близько відповідали Theta={0.1/2,1}. Приклад 4: Конструювання карти зчеплення і консенсусної карти Окремі карти YSC-, YDN- і TN-популяцій були побудовані за допомогою програми MAPMAKER/EXP 3.0 (Lander et al 1987; Lincoln et al 1992) при оцінці LOD 10,0 і функції картування Гальдана, а консенсусну карту будували за допомогою програми Phenomap Enterprise 3,0 (GeneFlow Inc., Centreville, VA). Генетичну YSC-карту будували з використанням 176 DH-ліній і 2982 поліморфних маркерів SNP, де загальна довжина становила 2515,8 сМ, а середня довжина становила 0,80 сМ/маркер. Генетичну YDN-карту будували з використанням 399 DH-ліній і 2972 маркерів SNP, де загальна довжина становила 2189 сМ, а середня довжина становила 0,74 сМ/маркер. Генетичну TN-карту будували з використанням 181 DH-лінії і 2716 поліморфних маркерів SNP, де загальна довжина становила 1905,7 сМ, а середня довжина становила 0,70 сМ/маркер, Консенсусну карту для 5500 маркерів SNP будували з використанням YDN-, YSC- і TN-популяцій. Приклад 5; Картування QTL Картування з інтервалами між складовими популяціями (СІМ) застосовували в програмі Cartographer V2,5 QTL (Wang et al 2011), що використовується для картування QTL. Оцінка LOD 3,0 була використана як порогова величина для ідентифікації геномних областей^ які мають значний вплив на ознаки кольору оболонки насіння і вмісту волокна. У таблиці 2 детально представлені ідентифіковані QTL кольори оболонки насіння і вмісту волокна. Результати показали, що основний QTL був ідентифікований на групі зчеплення (LG) N09, а другорядний QTL був ідентифікований на N11 для ознак кольору оболонки насіння, WI і L, і ознаки вмісту волокна ADF, в обох YSC- і YDN-популяціях. У YSC-популяції, основний QTL, ідентифікований для ADF на N09, співпадав із основним QTL для WI і L при величинах LOD від 40 до 47. Другорядний QTL, ідентифікований для ADF на N11, співпадав із другорядним QTL для WI і L при величинах LOD від З до 9 в YSC- популяції. Аналіз QTL для YDN-популяції також підтвердив результати, отримані для YSC-популяції. У YDN-популяції, основний QTL, ідентифікований для ADF на N09, співпадав із основним QTL для WI і L при величинах LOD від 136 до 143. Другорядний QTL, ідентифікований для ADF на N11, співпадав із другорядним QTL для WI і L при величинах LOD від 7 до 26. Таблиця 2:ФенотипІчна мінливість, ідентифікована (R2) за значущим QTL, відповідальним за ознаки вмісту ADF і кольору оболонки насіння (WI і L) в YSC- і YDN-популяціях з величинами LOD >3.ПопулядіаОзвакаГpyпa зчеплення% ідентифікованої мінливості (R2)LODYSC (n=176)Колір оболонкипасіння LN0960,841Koлip оболонкинасіння _WIN0959,240Вміст волокна_ADFN0971,547Колір оболочкинасіння LN116,38Колір оболонкинасіння WIN117,29Вміст волокна_ADFN112,43YDN(n=399)Коліроболоаілнасіння _LN0974,7143Колір оболонки насіння_WІN0974141Вміст волокна _ADFN0973,4136Колір ободонкинасіння_LN115,726Колір оболонки насіння_WIN115,926Вміст волокна_АDFN111,47 Приклад 6: Картування ADF і кольорів оболонки насіння як якісних ознак Через великий вплив основного QTL (R2=59,2%-74,7%) на N09, і бімодальних розподілів ознак вмісту волокна і кольору оболонки насіння в DH-лініях (фігури 1 і 2), кількісні ознаки вмісту волокна і кольору оболонки насіння можуть розглядатися як якісні ознаки. Виходячи із вмісту ADF і кольору оболонки насіння WI, DH-лінії обох популяцій були поділені на дві групи, одна з яких мала алелі з низьким вмістом волокна/високим WI і гомозиготні алелі YNO1-429, а інша група мала алелі з високим вмістом волокна/низьким WI і гомозиготні алелі Nex828 або DN051493 (фігури 1 і 2). У YSC-популяції, DH-лінії з алелями YN01-429 мали в середньому 10,0 ± 1,0 % ADF, а DH-лінії з алелями Nex828 мали в середньому 14,0 ± 1,6 % ADF в насінні каноли (фігура 1). В YDN-пoпyляцiї, DH-лінії з алелями YN01-429 мали в середньому 12,8 ± 0,% ADF, а DH-лінії з алелями DN051493 мали в середньому 18,5 ± 1,4 % ADF в насінні каноли (фігура 2). Після перетворення кількісних ознак ADF і WI в якісні ознаки, ADF (ADF_09) і WI (WI_09) були картовані на тій самій ген омній області, де основний QTL був локалізований на N09 в обох YSC- і YDN- популяціях. На фігурі 7 представлена карта локалізації основного QTL, ADF і WI, ADF_9 і WI_9, на карті YDN-популяції N09. Приклад 7: Тонке картування основного QTL на N09 УРК-популяція була потім використана для тонкого картування і підтвердження основного QTL на N09. Нова генетична карта N09 була побудована з використанням 1387 SNP. Фланкуючі маркери DBSNP01120 і DBSNP02172 визначали інтервал QTL 4,9 сМ, який відповідає 0,46 мегаоснов на еталонному геномі в. napus, DH12075, який був секвенований фахівцями Промислового Консорціуму AAFC, Основний QTL має R2 75 % на N09. Сліпий скринінг маркерів в інтервалі QTL із множиною популяцій, які були патентовані компанією DAS, яка здійснює програму селекції, підтвердив, що відповідність між фенотипом, передбаченим по маркеру, і фактичним фенотипом, становила ≥98 %, На фігурі 3 представлена генетична карта інтервалів QTL ADF разом із локусами ADF_09 і WIJ9. У інтервалі QTL 4,9 сМ на N09 були ідентифіковані НІ маркерів SNP, ключаючи фланкуючі маркери DBSNP01120 і. DBSNP02172. У таблиці 3 перераховані SNP, їх генетичні положення в сМ, алель YNO1-429, а також фізичні положення SNP на еталонному геномі В. napus (DH12075), SNP_NameSEQ ID NO:Положеннява парті (сМ)SNP_TypeSNP_ForwardГенотип YN01429Фізичне положення на еталонному геномі (u.o.)DBSNP011201117,4SNP[T/G]GGN9:35982462,.35983088DBSNP3572022117,4SNP[C/G]GGN9:35982582…35984072DBSNP3572033117,4SNP[T/GjTTN9:35982826…35984316DBSNP2222034117,4SNP[А/С]АСN9:35987647…35987947DBSNP3572085117,4SNP[T/G]GGN9:35994219…35995219DBSNP3572I46117,7SNP[A/G]ААN9:36025967…36026963DBSNP2222067117,7SNP[A/G]ААN9:36027874…36028174DBSNP3572158118,2QINDEL[-/А]ААN9:36030593…36031612DBSNP3572169118,2QSNP[T/G]TGN9:36030597…36031616DBSNP3572I710118,2QJNDEL[+/ATCACGCACCTGCA AATGT]ATCACGCACCT GCAAATGTN9:36030617…36031636DBSNP357218111l8,2QSNP[A/G]GGN9:36030736…36031756DBSNP35721912118,7SNP[A/G]GGN9:36030916…36031808DBSNP35722113119SNP[C/G]CCN9:36038430…36039006DBSNP35722214119SNP[T/G]TTN9:3603g430…36039335DBSNP35722315119SNP[A/G]GGN9:36038516…36039516DBSNP35722416119SNP[Т/С]CCN9:36038712…36039712 DBSNP22220817I l9SNP[T/C]ccN9:36039152…36039272DBSNP35722618l l9SNP[C/GjGGN9:36039465…36040465DBSNP35722719119SNP/1&)CCN9:36039710…36040708DBSNP35722820119SNP[T/C]MCN9:36039738…36040726DBSNP35722921119,3SNP[T/G]GGN9:36040629…36041743DBSNP35723022119,8SNP[T/C]cCN9:36041302…36042269DBSNP35723123l 19,8SNP[A/G]AAN9:36041326…36042293DBSNP35723224I 19,8SNP[T/C]ccN9:3ti041431…36042398DBSNP35723325119,8SNP[T/C]CCN9:36041470…3604243713BSNP35723426119,8SNP[T/C]ccN9:36041587…36042554I3BSNP35723527119,8sNP[A/T]AAN9:36042193.,36043188DBSNP35723628119,8INDEL[+/TT]TTN9:36042318…36043314DBSNP35723729119,8SN9[T/C]TTN9:36042320…36043316DBSNP35723830119,8SNP[A/T]TTN9:36042626…36043621DBSNP35723931119,8SNE[T/C]TTN9:36042629…36043624DBSNP3S724032119,8INDEL[+/A]+N9:36042765…36043760DBSNP35724133119,8SNP[A/G]AGN9:36043110…36044110DBSNP35724234119,8INDEL[-/T]TN9:36043117…36044117DBSNP35724435119,8SNP[T/C]CCN9:36043219…36044219DBSNP3S724536119,8SNP[T/C]CCN9:36043480…36044475DBSNP35724637119,8SNP[A/T]TTN9:36044691…36045691DBSNP35724738119,8SNP[A/T]TTN9:36045200…36046200 DBSNP04324 39 119,8 SNP [T/C] CC N9:36046568…36t)47839 DIJSN P357249 40 119,8 SNP [A/G] AA N9:36046761,.36047762 131ìSNP357250 41 119,8 SNP [A/G] AA N9:36046762…36047763 DBSNP35725I 42 119,8 SNP [A/G] AA N9:36046778…36047779 DBSNP357252 43 119s SNP [A/G] GG N9:36046868…36047869 DBSNP357253 44 119,8 SNP [A/G] GG N9:36046920…36047921 DIISNP357254 45 119,8 INDEL [+/T] + N9:36047652…36048534 DBSNP3S7255 46 119,8 SNP [T/C] TT N9:36047710…36048534 DПSNP357256 47 119,8 SNP [DGJ GG N9:36047752…36048534 DBSNP3572S7 48 119,8 SNP [T/C] CC N9:36047876…36048534 IЭBSNP3572S8 49 119,8 SNP [A/O] AA N9:36047941…36048534 DBSNP357259 50 119,8 SNP [T/C] TT N9:36048002…36045534 DBSNP357260 51 119,8 SNP [C/G] GG N9:36048012…3604ß534 DПSNP357262 52 119,8 INDEL [+/A] + N9:36048530…36049322 DBSNP357263 53 119,8 SNP [A/T] TT N9:36048530…36049347 DHSNP357264 54 119,8 SNP [A/T] TT N9:36048530…3ó049442 DBSNP357265 55 119,8 SNP [A/G] AG N9:36048S30…36049520 DBSNP357266 56 119,8 SNP [A/G] AA N9:36048564…36tl49565 DBSNP357267 57 119,8 SNP [C/G] CC N9:3604fi641…36049642 DBSNP357268 58 119,8 SNP [A/C] CC N9:36048645…36049Г›46 DBSNP357269 59 119,b SNP [T/C] TC N9:36048651…36049652 D8SNP357270 60 119s SNP [c/c] CC N9:36048792…3ó049793DBSNP35727161119,8SNP[T/C]CCN9:36048794…36049795DBSN935727262119,8INDEL[+/A]+N9:36048932…36049933DBSNP35727363119,8SNP[A/T]TTN9:36048985…36049986DBSNP35727464119,8SNP[A/G]AGN9:36049082…36050083DBSNP35727565119,8SNP[T/C]TCN9:36049455…36050457DBSNP35727666119,8SNP[A/G]AAN9:36049482…36050484DBSNP35727867119,8SNP[C/G]CCN9:36049554…36050556DBSNP35728068119,8SNP[T/G]TTN9:36049653…36050643DBSNP35728269119,8SNP[T/G]TTN9:36049758…36050643DBSNP35728670119,8SNP[A/G]AAN9:36054018…36055018DBSNP22221071119,8SNP[A/G]AGN9:36054461…36054578DBSNP35728772119,8SNP[A/T]TTN9:36054757…36055757DBSNP35728873119,8SNP[A/G]GGN9:36054789…36055789DBSNP35728974119,8SNP[T/C]CCN9:36054810…36055810DBSNP35729075119,8SNP[A/G]AAN9:36054813…36055813DBSNP35729176119,8SNP[A/C]CCN9:36054956…36055956DBSNP35729277119,8SNP[C/G]CCN9:36054966…36055966DBSNP35729378119,8SNP[T/C]TTN9:36054983…36055983DBSNP35729479119,8SNP[T/C]TTN9:36055008…36056008DBSNP8450880119,8SNP[A/C]ACN9:36055121…36055879DBSNF22221181119,8SNP[A/G]GGN9:36060768…3606096äDBSNP22221282119,8SNP[A/G]GGN9:36061805…36061924 DBSNP22221483119,8SNP[A/G]AAN9:36076182…36076301DBSNP22221984119,8SNP (домінантний)(T/G]--N9:36096659…3609d732DBSNP22222085119,8SNP (домінантний)[A/C]--N9:36096733…36096814DBSNP24071586119,8SNP[A/G]AGN9:36100799…36100917DBSNP22222287119,8SNP[A/G]GGN9:36119793…36119830DBSNP3829588119,8SNP[A/G]GGN9:36132536,.36133536DBSNP22222589119,8SNP[A/G]GGN9:36132936…36133136DBSNP22222690119,8SNP[A/G]AAN9:36136254…36136558DBSNP082I291119,8SNP[A/G]AAN9:36143105…36143329DBSNP0821492119,8SNP[T/G)TTN9:36143105…36143329DBSNP22222893119,gSNP[T/C]CCN9:36147820…36147940DBSNP22222994120,1SNP[A/G]AAN9:36156553…36156673DBSNP4212695120,1SNP[T/G]GGN9:36157370…36158339DBSNP22223196120,1SNP[T/C]TTN9:36165969…36166169DBSNP22223397120,6SNP[A/G]AAN9:36175905…36176121DBSNP22223598120,6SNP[A/G]AAN9:36190213…36190333DBSNP14659899120,6SNP[T/C]TCN9:36207823…36208597DBSNPI47032100120,6SNP[A/G]AGN9:36212362…36213110DBSNP94819101120,6SNP[T/G]TGN9:36213988…36214561DBSNPI58066102120,6SNP[A/T]TAN9:36214885…36215409 DBSNP158078 103 120,6 SNP [T/C] CC N9:36214926…36215606 DBSNP63288 104 121,4 SNP [T/G] TG N9:36278558…36279063 DBSNP52362 105 121,4 SNP [T/C] + N9:36279239…36280186 DBSNP222241 106 121,4 SNP [T/C] -- N9:36291810…36291930 DBSNP222242 107 121,4 SNP [T/C] TT N9:36308543…36308663 DBSNPI89108 108 12 s4 SP [T/C] TC N9:36308946…36309355 DBSNP222244 109 121,7 SNP [T/C] CC N9:36353147…36353447 DBSNP222246 110 122 SNP [T/G] TT N9:36372163…36372403 DBSNP02172 111 122,3 SNP [C/G] CC N9:36447139…36448664 У інтервалі QTL ADF 4,9 cM, фланкованому DBSNP01120 і DBSNP02172, був визначений субінтервал, в якому маркери є особливо цінними для маркер-опосередкованого відбору. Фланкуючі маркери DBSNP35722 і DBSNP222211 визначають субінтервал 0,5 сМ для області гаплотипу, яка є унікальною для донора YN01-429. Фланкуючі маркери DBSNP35722 і DBSNP222211 і маркери в субінтервалі можуть бути використані з метою маркер-опосередкованого відбору для ідентифіікації QTL на N09 при селекції рослин на поліпшені властивості АСМ.